首先，从精神情绪和思维意识方面来看气功“三调”中的“调心”过程。这是在摆好一定练功姿势，或调整好呼吸方式及意守放松的基础上，排除杂念，意念归一，大脑逐渐进入一种特殊的“入静”状态，此时，脑细胞的活动趋向有序化，大脑得到充分的休整，从而调整了大脑皮层的活动，增强了皮层和皮层下中枢的协调性，降低了机体的应激状态和对环境劣性刺激的敏感性，提高了机体的修复和抗病能力。

据近年来研究，气功的“入静”，不同于一般的安静状态，也不是大脑皮层的抑制过程，而是脑细胞的活动处于一种有序化的同步状态，也就是说，气功的入静，并不是简单或消极的抑制，而是大脑处于一种积极休整的活动状态，因而可修复和调整各种神经机能的紊乱。练功得法，除了主观上感到心情无比愉快以外，还能提高智力。近几年来，有关气功能增强记忆力，提高学习效率或工作能力的报导时有所见，扩展了气功应用范围。

其次，通过“三调”中的“调息”过程，产生复杂的呼吸生理神经反射机制，这一方面加深了大脑的入静过程，同时也通过深长柔缓的呼吸运动，增强了肺泡的氧交换作用，激发了心血管和全身各个系统的功能。特别是随着加深的腹式呼吸运动，产生内脏按摩的作用，增强了胸腹腔内脏器的血液循环，消化液的分泌，胃肠道的蠕动，因而改善了消化吸收机能。

第三，通过“三调”中的“调身”，即躯体姿势和动作的锻炼，以及静极而动的自发功和自我保健按摩等，这一方面有助于大脑进入入静状态，同对也促进了神经系统和心血管系统的正常功能，并影响到全身各个系统。当然，气功的动功和一般的操练运动不同，它的特点是柔和缓慢，并要求动作和意念、呼吸的密切配合，这更有助于加强气血的运行和纠正生理机能的紊乱，对年老体弱有慢性疾病的人更为合适。至于某些难度较大的动作，架式较低的姿势，以及较剧烈的自发动功，则适合于体质较强的人或中青年以及某些精神神经和运动系统的患者，但不适合有严重心血管疾患或精神障碍的患者。