穴位的发展过程，大致经过三个阶段，“以痛为腧”阶段、经验取穴阶段 和系统整理上升为理论的阶段。

所谓“以痛为腧”（《灵枢·经筋》)，就是按照病痛取穴，因为没有固定 的部位，也就无所谓穴名和经络的概念。唐孙思邈《千金要方》说明“阿是 穴”时指出。

吴蜀多行灸法，有“阿是”之法，言人有病痛，即令捏其上，若里当其处，不问 孔穴，即得便快，成痛处即云阿是，灸刺皆验，故曰阿是穴。

这种取穴法不受经穴、奇穴的束缚，以体表的反应点（压痛点）为穴，不仅是 上古时“以痛为腧”的遗风所现，迄今仍不失为发现新穴位治疗作用的有效 方法之一。因为属非已知的穴位，故孙氏但以吴蜀方言“阿是”为名泛称 之，反映了医者在治疗中触摸按压寻找压痛点的生动场景。

随着治疗经验的积累，穴位治病的特异作用由不知而逐渐知之较多， 从不固定而趋向固定其位置，进而定名，进入了经验取穴的发展阶段。经穴 的定名，则便于进一步观察和总结其治疗作用，并进一步发现其中属于规 律性的内在联系。所谓“论理人形，列别藏府，端络经脉，会通六合，各从其 经；气穴所发，各有处名”（《素问·阴阳应象大论》），则反映了其理论形成 的总结和认识深化的过程。《内经》时代不但确立了经络学理论，而且对经 穴的治疗作用、针灸治疗的循经取穴、进针虚实补泻手法、针刺治疗禁忌等 均有原则性的阐述。仅其所载十四经（十二经加督任两脉）经穴名即有160 多个。至晋皇甫谧辑集《针灸甲乙经》时，经穴已增至354个，以后代有增 益，至清《医宗金鉴》经穴总数为361个。至于非十四经经穴范围的“经外奇 穴”、“阿是穴”等，那就更多了。新中国成立以后，随着针灸临床的研究和 中西医结合研究的深入发展，不断丰富和充实对原有穴位认识的基础上， 更增加了许多新的取穴方法和新的穴位。如目前临床上发展起来的按神经分布取穴、按肌肉运动点取穴、耳针取穴、头皮针取穴等，均是对经外奇穴的补充。

经络是人体气血运行的通道，同时又是人体内脏与体表发生联系的作 用途径。从针灸治疗的角度来看，分布于体表不同部位的穴位多属于一定 的经脉，因此不妨可以认为经络学说的价值就在于其是指导临床诊断和治 疗的有关穴位主治规律的理论。从体表看，经络就是穴与穴之间的线状联 系；从体表与内脏联系来看，它反映了穴位同内脏相对的特异性作用。这就 说明了穴位不仅有其局部的、邻近的治疗作用，还有通达脏腑的远道治疗 作用；穴位不但有其各自的治疗适应证，而且同一经脉的许多穴位其主治 范围大体相似的原理。因此，古代医家提出了一些包括五输穴、原穴、背俞 和募穴、交会穴等在内的特定的要穴，在体现这种治疗联系方面尤具重要意义。