晋隋唐时期，火针疗法有了很大的发展，不但火针的名称直呼于此，而且火针的治疗范围较前有了很大扩展。火针疗法已经用于内科、外科以及急证的治疗；同时，火针的选穴操作、禁忌等问题均已提出，而且出现了火针治疗的医案记载。

晋代我国现存的第一部针灸学专著——《针灸甲乙经》对针灸经络学进行了系统的整理，全面总结了我国针灸学的理论及临床经验。书中对火针疗法的论述未出《内经》之右，但肯定并转载了《内经》中有关火针的内容，为火针的流传起到了承前启后的作用。

晋代陈延之《小品方》中最早出现了“火针”的名称，书中记载：附骨疽“若失时不消成脓者，用火针、膏、散”，这也是火针疗法用于外科证候的较早记载。疗眼生胬肉覆瞳子者方言：“取针烧令赤，烁著肤上，不过三烁缩也。”第一次把火针疗法应用于眼科疾病，开创了火针治疗目疾的先河。

唐朝孙思邈的《千金方》中不但将火针用于治疗痹证，而且多用于外科疮疡痈疽、？疬痰核和出血，同时也用于内科黄疽、癫狂等证。如记载：“痈有脓便可破之，令脓宜出，用铍针，脓深难见，肉厚而生者用火针。”又言“…当头以火针，针入四分瘥。”“外疖痈疽，针惟令极热”，“诸漏结核未破者，火针使着核结中，无不瘥者”。“治酒醉牙齿涌血出方，烧针令赤，注血孔中止”。


“侠人中穴火针，治马黄疸疫通身并黄，语音已不转者”，同时孙氏在刺鬼十三针法中，其鬼路、鬼枕、鬼床、鬼堂四穴，刺法中均言“火针七锃，锃三下”。在孙氏的记载中也提出了火针“令极热”的操作要点和火针刺“侠人中”、“鬼路、鬼枕…”等穴位的记载，打破了火针“以痛为腧”的选穴方法。同时孙氏还提出了火针的禁忌穴位：“巨阙、太仓，上下篇此一行有六穴，忌火针也。”

宋代王执中的《针灸资生经》中经医案的形式，记载了火针疗法在内科疾病中的应用，描述了心腹痛、哮喘、腹寒热气、腰痛、尸厥、膝肿等多种病证的火针治疗过程。如治心腹痛，“…令女儿各以火针微针之，不拘心腹，须臾痛定”；又如治哮喘，“只缪肺俞，不缪他穴”。


王执中在书中记载火针治疗病案四则，均论述甚详，钩画清晰，使人读之，即对其发病及治疗的全过程有了全面的了解。他不仅开创了火针病案记载的先例，而且应用火针刺法灵活。取经穴或痛处，甚则“不拘心腹何处”，“以火针微刺之”，均见疗效。说明他对火针方法的运用已达随心应手的地步，堪称火针之大家。

这一时期还有许多火针的记载，如《圣济总录》中不仅明确提出痈疽成脓期是火针治疗的最好时机，而且从机理上进行了探讨，认为：“肿内热气，被火夺之，随火而出。”即火针起到了以热引热、引邪外出的作用。从而完善了火针治疗痈疽肿疡的理论，开创了火针治疗的新天地。《外台秘要》中详细描述了用火针去除脑后结节的方法，为火针治疗体表肿物的先驱。